南京医科大学附属南京市儿童医院烧整科是江苏省临床重点科室、南京市临床重点科室，中华医学会南京学会烧伤整形外科学会副主任委员所在单位。烧伤整形外科从1979年开始组建，1980年成立烧伤整形组，正式成立于1998年，是全国儿童医院中最早成立整形外科的医院。现有床位49张

业务内容涉及烧伤整形外科的所有领域，包括儿童美容外科，显微外科，血管外科,颅面外科,手外科，功能修复和重建外科。

整形功能修复和重建外科：包括各种疤痕预防和整形，体表良恶性肿瘤、各种血管瘤、淋巴管瘤，慢性溃疡的综合治疗。淋巴水肿（俗称象皮肿）的治疗，会阴部、包皮整形术，体表巨大缺损的修复等。

颅面外科：各类唇腭裂修整术，I期全耳再造术，鼻再造.严重颅面畸形,如眶距增宽，斜头畸形，面裂畸形，半侧颜面发育不全。一些颅面畸形综合征,如面中部发育不全(Crouzon综合征)，Pierre-Robin综合征，Treacher Collins综合征等。

儿童美容外科：开展了重睑术、内眦赘皮、上睑下垂、义眼等,鞍鼻、驼峰鼻矫形，鼻尖鼻翼的修整。隐耳、杯状耳、小耳畸形、招风耳。颧骨缩小、下颌角肥大、咬肌肥厚、丰颞、梨状孔周围充填。吸脂、超声去脂、腹壁手术整形。反转皮瓣、小切口彻底根治腋臭。处女膜修补、小阴唇肥大、阴茎延长、包茎、包皮成型等。磨除各种不良纹身，纹眉和眼线，外伤性的色素沉着，治疗太田痣、胎记、雀斑、各种色斑、血管瘤、毛细血管扩张、酒糟鼻等。 永久植发：毛发移植治疗脂溢性秃发及瘢痕性秃发。

手外科：各种手外伤的修复。

显微外科：已成功地进行各种游离皮瓣的移植。

烧伤科：经过多年临床实践，我们在儿童烧伤休克的防治、感染及应激性溃疡等并发症的防治、营养支持及创面治疗等方面形成了一整套用适合小儿特点的治疗方法，

颅面外科中的牵引成骨术治疗新生儿Pierre-Robin综合征和Crouzon综合征,新生儿唇腭裂修复、眶距增宽症的治疗、斜头畸形、面裂畸形、半侧颜面发育不全在国内领先.血管瘤和淋巴管瘤的治疗、慢性溃疡的治疗是南京市儿童医院的特色项目，在国内也处于领先地位。新生儿大面积严重烧伤是南京市儿童医院的特色项目，在国内处于领先地位。